会计科目设置只要不违反国家会计准则制度规范的，主要还是要结合企业管理的实际需要设置科目，你说的税的处理问题那只是税收处理，可以和会计处理有差别，做所得税汇算清缴的时候只要把该交的税交了，会计处理税务不管就。
软件使用费计入无形资产科目一无形资产收到软件开发服务费的发票可以作为无形资产反映无形资产属于资产类科目，无形资产是指企业拥有或者控制的没有实物形态的可辨认非货币性资产无形资产包括专利权非专利技术商标权。
按照企业会计制度的科目设置建账就可以了，只是在记账的时候在管理费用中明确开发费用的部分。
无形资产的摊销金额一般应当计入当期损益，其他会计准则另有规定的除外根据财政部 国家税务总局关于企业所得税若干优惠政策的通知财税20081号 的规定企事业单位购进软件，凡符合固定资产或无形资产确认条件的。
软件企业研发人员工资计入 ”管理费用研究开发费工资”会计科目。
首先要在资产类会计科目中增设“项目成本”科目，来归集各种直接成本和间接成本“项目成本”科目要设置成对部门和项目进行辅助核算的科目目前常用的财务软件如用友金碟等都有辅助核算功能，期末利用辅助核算功能可以很容易。
