复活后的尼奥对自己“救世主”的身份已无丝毫怀疑，明白到自己有重写矩阵内程序的能力他马上入侵了其中一个特工程序史密斯，令史密斯烟消云散，消失得无影无踪，其他的特工程序吓得落荒而逃；剧情介绍八个城中专业人士，一天醒来，赫然发现身处一个神秘密室，无人知道这是何等地方，眼前的只是一班完全不相识的人密室是四方...